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CY5-4-巰基尿苷,CY5-4-Thiouridine,RNA研究中的多功能硫修飾核苷的熒光探索

2026年03月11日 19:59
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物理化學特性

光譜特征:在pH 7.0水溶液中,最大吸收波長約331 nm(ε ≈ 21,000 M?1cm?1),該吸收源于n-π*躍遷,常用于濃度定量。

反應性:巰基/硫酮基具有親核性,易與烷基化試劑(如碘乙酰胺)或馬來酰亞胺發(fā)生加成反應,也可在UV 365 nm照射下與鄰近堿基交聯(lián)。

穩(wěn)定性:對酸敏感,強酸中糖苷鍵易水解;硫原子易被氧化為亞砜,需避光冷藏保存。

功能應用

tRNA結構穩(wěn)定劑:在細菌tRNA中作為保守修飾,通過增強堿基堆積力穩(wěn)定L形三級結構,提高翻譯準確性。

RNA光交聯(lián)探針:將s?U摻入RNA后,紫外照射可使其與結合蛋白質形成共價交聯(lián),用于繪制RNA-蛋白質相互作用圖譜(如PAR-CLIP技術)。

代謝標記工具:在細胞培養(yǎng)中利用4-硫代尿苷(s?U)脈沖標記新生RNA,通過生物素-馬來酰亞胺偶聯(lián)純化,分析轉錄組動態(tài)(如SLAM-seq)。

實驗反應示例

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